6
Экзамен на алхимика
Мустанг знакомит Элриков с Шу Такером, Соединяющим жизни алхимиком. Элрики селятся у него и старательно готовятся к экзаменам.
Элрики и Нина присутствуют при родах миссис Хьюз. Эдвард впервые совершает преобразование без алхимического круга, просто хлопнув в ладони.
Эдвард становится государственным алхимиком. 

7
Ночной плач химеры
Эдвард ищет информацию об исследованиях Государственного алхимика Шу Такера, создавшего химер понимающих человеческую речь. Правда оказывается ужасной…

8
Философский камень
Эд отдаёт часы Мустангу.
В Столицу пребывает Уинри; Риза Хоукай и Кинг Бредли рассказывают Альфонсу о философском камне. Барри-мясник похищает Уинри и отвозит девочку на скотобойню, где её находит Эдвард, а Альфонс позже прибывает вместе с военными.
Эдвард снова гос. алхимик. Мустанг разрешает заняться исследованием философского камня.

9
Серебряные часы армейского пса
Братья отправляются в город Юсвелл для инспекции угольных шахт.
Эдвард обманом заставляет лейтенанта Юкки продать шахты и передаёт все права жителям города.
Мустанга повышают в должности и отправляют в восточную штаб-квартиру.   
Последняя сцена: три года спустя, Эд и Ал едут по пустыне. Эд разговаривает с водителем о себе любимом и выпрашивает комплименты 

10
Загадочный вор Сирена
Старший брат – 15 лет, младший – 14 лет.
Элрики приезжают в Акваройя. Местная полиция просит помочь с поимкой преступника, который позже оказывается преступницей, да ещё и медсестрой, а потом монахиней, воспитательницей в детском саду… Эдвард ловит Псайрен и передаёт в руки полиции, но девушка сбегает.
Элрики едут в Ксенотайм.

21
Алый блеск
В глубине Пятой лаборатории Эд, встретив химер и их создателя — Шу Такера, узнаёт, что тот пытается создать философский камень. Шрам и Ал вступают в бой с Похотью и Обжорством.

22
Искусственные люди
Такер и гомункулы требуют от Эдварда создать философский камень. Эд отказывается, не желая приносить для этого в жертву людей. Младший лейтенант Росс спасает Эда, который потерял контроль над процессом трансмутации. Ал, потерпев поражение от Обжорства, узнаёт о возможности привить воспоминания, что укрепляет его сомнения в своём происхождении. Гомункул Жадность и Багровый Алхимик вырываются на свободу.

23
Стальное сердце
Эдвард лежит в больнице, механик Уинри Рокбелл едет в Централ, чтобы починить его автоброню, подполковник Хьюз пытается разобраться в произошедшем в 5-й лаборатории. А Альфонс всё сильнее сомневаясь в том, что раньше он был живым, в конце концов ссорится с братом и сбегает от него.

24
Прикрепление воспоминаний
Альфонс попадает в трущобы ишварских беженцев, где встречает со Шрамом. Вместе они спасают ишваритов от преступников, переодетых в солдат. Им на помощь приходит Эд. Братья смогли помириться.

25
Прощальная церемония
Подполковник Хьюз с санкции фюрера продолжает расследование дела 5-й лаборатории, а Эд и Ал решают отправиться на юг, к своему Учителю, Изуми Кёртис. Уинри едет с ними. Шрам сопровождает ишварских беженцев на юг. Хьюз узнаёт, что в окружение фюрера пробрались враги и погибает. Мустанг успевает лишь на похороны друга.

26
Её причины
Эд, Ал и Уинри приезжают в город Рашвилль — «столицу автоброни». Там они знакомятся с девушкой по имени Панинья. Желая помочь новой знакомой, Уинри подговаривает её обокрасть Эда. В конце неожиданно появляется Учитель братьев Элриков, вызывая у них панику.

27
Учитель
Полковника Мустанга переводят в Централ вместе с отобранными им людьми. Эд и Ал признаются своему Учителю, что пытались совершить запретное преобразование человека.

28
Всё это одно, а одно это всё
Учитель братьев отправляет их на месяц на необитаемый остров, желая дать им время спокойно подумать о своей жизни. Элрики вспоминают, как жили на острове в первый раз и, одновременно, ищут незнакомца, обитающего рядом с ними.

29
Невинное дитя
Изуми и братья находят странного ребёнка — он ничего не помнит о себе, но способен использовать алхимию без преобразовательного круга. Эд вспоминает Врата Истины, которые он видел в тот день, когда не смог вернуть маму. Военные ищут Стального алхимика. Братья Элрики понимают, что у найдёныша пропавшая рука Эда, а Изуми отправилась на остров, надеясь понять откуда взялся странный ребёнок.

30
Штурм южной штаб-квартиры
Бывший лейтенант Йоки доносит армии о появлении на юге Шрама. Братья Элрики, преследуя найдёныша, сталкиваются с химерой, человеком-ящерицей. Эд и Ал нашли ребёнка, но его арестовывает Армстронг, так как на его ноге обнаружили знак гомункула. Изуми проникает в штаб Южного округа, чтобы спасти мальчика, а её муж рассказывает, почему у них нет детей. Там же оказываются подполковник Арчер, Армстронг и фюрер, братья Элрики и члены банды Жадности, всем им нужен ребёнок. Мустангу отдан приказ любой ценой схватить Шрама.

41
Святая мать
Шрам обвинил Эда в бедах жителей Лиора. Марта перед смертью успела рассказать Алу правду про фюрера. Шрам сообщает жителям Лиора о планах военных и предлагает им покинуть город. Эд смог предупредить Мустанга о планах Шрама. Мустанг посылает Ала в Лиор на помощь брату. Фюреру приказали отложить взятие города. Горожане пытаются спастись через подземный тоннель, но путь им преграждает Гнев, в бой с которым вступает Эд. Шрам расправляется с проникшими в Лиор химерами и Багровым алхимиком. Кимбли превращает Альфонса в бомбу замедленного действия. Эдвард встречает секретаря фюрера Джульетту Дуглас и понимает, что это гомункул, созданный им при попытке вернуть свою мать. Роза спасает поражённого Эда от Гнева.

42
Не зная его имени
Эдварду пришлось принять бой сразу против и Гнева, и Лени. Мустанг находит убежище Такера и тот, по приказу Арчера, натравливает на него химер. Эду удалось вывести горожан из Лиора. Армия входит в город. Солдаты стреляют в Похоть, но Шрам закрывает её своим телом. Эд безуспешно пытается остановить Арчера, командующего взятием Лиора. Шрам привёл в действие алхимический круг. Пытаясь спасти Ала от смерти, он преобразует в философский камень не себя, как задумывал ранее, а доспехи Альфонса. Отчасти у него это получается. Лиор и вошедшие в него войска почти полностью прекратили своё существование. Эд находит Ала.

43
Бродячий пес в бегах
Уинри и Ческа приезжают в Ризенбург, где неизвестный принимает Уинри за её мать. Этот человек оказывается отцом братьев Элриков по фамилии Хоэнхайм. Эд, не желая больше служить в армии и опасаясь Гордыни и Лени, сбегает вместе с Алом. Фюрер обвинил братьев Элриков в помощи Шраму и поручил Мустангу найти их и в случае необходимости убить. В Ризенбург приезжают Мария Росс и Дэнни Блош, бывшие телохранители Элриков. Братья возвращаются в Ризенбург, где их выслеживает Мустанг. Загнав Элриков в ловушку Рой лишь спрашивает, почему они не попросили помощи у него.

44
Светлый Хоэнхайм
Похоть не хочет охотиться за братьями Элриками и другие гомункулы обвиняют её в предательстве. Ал сообщает Мустангу и другим, что Кинг Брэдли — гомункул, а позже проговаривается о философском камне, созданном Шрамом. Эдвард и Альфонс встречаются со своим отцом, но Эд так
его и не простил. Хоэнхайм рассказывает Мустангу про гомункулов, а потом всю ночь беседует с Алом. В Ризенбург за братьями прибыла следственная группа. Элрики узнают о смерти Хьюза. Хоэнхайм находит Данте и требует оставить в покое его сыновей.

45
Человек с гниющим сердцем
Данте вспоминает, как 400 лет назад они с Хоэнхаймом любили друг друга и вместе создали философский камень, позволивший им переселять свою душу из одного тела в другое, продлевая жизнь на века. Высший совет Аместриса рассматривает дело Эдварда Элрика. Мустанг сообщает совету, что братья Элрики, якобы, ушли на север, после чего заявляет, что секретарь фюрера замешана в убийстве Хьюза. Хоэнхайм рассказывает Данте, что вечной жизни нет, с каждым переходом в другое тело душа изнашивается, из-за чего каждое новое тело служит меньше чем предыдущее. С помощью ребёнка Розы Данте открывает Врата Истины, которые поглощают Хоэнхайма, а затем приказывает доставить ей философский камень, обещая, что сделает гомункулов людьми. Эдвард собирается найти того, кто управляет гомункулами и убить. Альфонс встречается с Такером и просит его научить использовать философский камень. Фюрер отправляет Мустанга на передовую, чтобы там незаметно убить.

46
Человеческая трансмутация
Такер с помощью философского камня, которым является Ал, хочет оживить свою дочь. Эдвард начинает догадываться, что Данте руководит гомункулами. Мустанг отправляется на Север. Данте нужна война на Севере, чтобы незаметно устранить всех, кто так или иначе связан с философским камнем. За Алом охотятся все гомункулы. Похоть, понимая, что Данте обманывала их и заставляла искать философский камень ради своих целей, решила помочь Эдварду найти Ала, чтобы тот с помощью философского камня сделал её человеком. Вместо дочери Такер получил бездушную куклу.

47
Запечатывание гомункулов
Лень хочет увести Ала с собой к Данте. Ал, видя, как она похожа на мать, верит ей. Эдвард останавливает их и начинает бой с Ленью. Предвидя схватку с ней, он заранее вырыл часть останков своей матери, чтобы использовать их против гомункула. Похоть, помогая Эдварду, вычертила алхимический круг - ловушку для Лени. Гнев мешает Эду запечатать Лень, а затем вступает в схватку с Похотью. Лень проникает внутрь доспехов Ала и берёт их под контроль. Гнев использует алхимию и частицы прототипа Похоти, чтобы убить её. Эдвард с трудом, но побеждает Лень, трансмутировав её тело в этанол.

48
Прощание
Армстронг поднимает мятеж против фюрера. Зависть похищает Ала. Гнев, считавший Лень своей матерью, нападает на Эда, ему на помощь приходит Изуми. Трингамы приезжают в Централ, где их арестовывают, приняв за братьев Элриков. Мустанг и Хоукай тайно остались в Централе. Росс и Блош освобождают братьев Трингамов, а потом они вместе помогают Эду и Изуми. На них нападает Арчер, чья правая часть тела заменена автопротезами. Эд сталкивается с Мустангом. Рой собирается убить фюрера, а Эдвард хочет найти того человека, который управляет гомункулами и убить его. Их пути расходятся, и они прощаются.

49
По ту сторону Врат
Фюрер празднует день рождения сына. Зависть доставляет Ала к Хозяину. Эд, прочитав дневник Нэша Трингама, который привезли его сыновья, находит под Централом город, исчезнувший с лица земли 400 лет назад в результате создания философского камня. Там он встречает Розу с ребёнком и Данте в теле Лайлы. Данте, разоблачённая Эдом, сообщает ему, что имеет право пользоваться философским камнем для продления жизни, так как защищает мир и «глупых людей», которые могли бы погубить себя с помощью камня. После разговора и непродолжительной схватки Эд оказывается в другом теле и в другом мире, где встречает своего отца.

50
Смерть
Отец сообщает Эду, что они по другую сторону Врат и тот понимает, что их открыла Данте с помощью ребёнка Розы. От отца Эд узнаёт, что жизни людей, погибших в этом мире, пройдя через Врата, становятся источниками энергии для алхимии в мире Аместриса. В городе под землёй собираются вместе Данте, Роза с ребёнком, Зависть, Гнев, Обжорство и Ал. Обжорство переживает, потеряв близких ему Похоть и Лень. Чтобы заставить его подчиняться, Данте лишает его разума. Начинается бой между Мустангом и Гордыней. Гнев требует воскресить его маму, Данте вновь открывает Врата из-за чего гомункул теряет ногу и руку Эда. Неожиданно Врата открылись вновь и из них появляется Эдвард, который погибает в борьбе с Завистью.

61
Пути расходятся
Фюрер Брэдли навещает Эда в больнице и предупреждает братьев Элриков быть осторожными со всеми военными. Эдвард и Альфонс решают отправиться в город Дублис, где живёт их учитель алхимии, Изуми Кёртис, надеясь узнать от неё о философском камне. Уинри, узнав, что на пути к Дублису находится город Рашвелл, известный своими мастерами автоброни, отправляется с ними. Хьюз обнаруживает связь между восстанием в Лиоре, Пятой лабораторией и войной в Ишваре. На него нападает Похоть. Хьюз сбегает от неё и пытается связаться с Мустангом, но его убивает Зависть, принявший облик Росс. Хьюз посмертно произведён в звание бригадного генерала. Мустанг расследует убийство друга и с помощью Армстронга приходит к выводу, что ответственность за смерть Хьюза может нести кто-то из руководства армии.

62
Чудо в Рашвелле
В Рашвелле Панинья, ставшая воровкой, чтобы помогать своему приёмному отцу, крадёт у Эда его серебряные часы, знак государственного алхимика. Выследив девушку, братья Элрики и Уинри знакомятся с её отцом, Домиником, поразившим их своим умением делать автоброню. Уинри просит Доминика взять её в ученики, но получает резкий отказ. Зато Уинри смогла убедить Панинью вернуть часы и перестать воровать. В это время у снохи Доминика начинаются родовые схватки. Из-за плохой погоды женщину нельзя отвезти в город и Доминик уезжает за врачом. Уинри приходится принимать роды. После рождения внука Доминик несколько смягчился и направил Уинри к другому механику, у которого она сможет учиться. Оставив Уинри в Рашвелле, Эдвард и Альфонс уезжают в Дублис.

63
Одно есть всё, всё есть одно
Эдвард и Альфонс приезжают к Изуми и её мужу Зигу. Братья вспоминают, как они впервые встретились с учителем во время наводнения в Ризенбурге и как смогли уговорить её взять их в ученики. Первым делом Изуми отвезла братьев на необитаемый остров, где оставила на месяц, заявив, что будет их учить только если они поймут смысл фразы «Одно есть всё, всё есть одно». Встретив после долгой разлуки своих учеников, Изуми понимает, что Ал лишился тела, а также то, что Элрики пытались совершить запрещённое преобразование человека. Отругав братьев, Изуми рассказывает, что она сама пыталась возродить умершего сына. Именно тогда она потеряла часть внутренних органов.

64
Твари Даблиса
Отныне Эдвард и Альфонс не ученики Изуми, а равные ей. Полковника Мустанга переводят в Централ вместе с отобранными им людьми. В лагере беженцев старейшина ишваритов советует Шраму перестать мстить. Йоки и два бандита пытаются схватить Шрама, чтобы выдать его армии, но терпят поражение, после чего Йоки, желая спасти жизнь, клянётся Шраму служить верой и правдой. Ала заманивают в ловушку и пытаются захватить химеры из банды гомункула Жадность. Эдвард находит Жадность, который предлагает обучить его созданию гомункулов в обмен на информацию о том, как прикрепить душу человека к доспехам. Эд отказывается и нападает на Жадность, но тот благодаря
своему «Абсолютному щиту» неуязвим для атак. Тем не менее, Эдвард находит способ нанести вред Жадности. Неожиданно в их схватку вмешивается Изуми.

65
Те, кто скрывается под землёй
Солдаты под командованием Брэдли и Армстронга нападают на бар «Гнездо Дьявола», штаб-квартиру банды Жадности. Пока солдаты убивают бандитов из числа простых людей, фюрер спускается в канализацию, где вступает в поединок с Жадностью. Брэдли оказался сильнее, хотя для этого ему пришлось раскрыть свою истинную сущность. Роа и Дольчетто, пытаясь спасти Жадность, погибают от руки фюрера. Мартел, скрывавшаяся внутри доспехов Ала, пытается задушить Брэдли, который её убивает. Её кровь попадает на печать Альфонса и снимает блок с его воспоминаний. Ал рассказывает Эду, что ему удалось восстановить воспоминания о Вратах Истины, к которым он попал во время неудачной попытки оживить маму. Обессиленного Жадность взяли в плен, чтобы доставить его к Отцу, против которого он когда-то взбунтовался. Отец готов простить мятежника, но Жадность отказывается присоединиться к гомункулам, и Отец возвращает его в своё тело.

66
Посланцы с Востока
Шрам расправляется с государственным алхимиком, известным как «Серебряный алхимик». Вернувшись в своё временное укрытие, Шрам обнаруживает там помимо Йоки девочку, принцессу клана Чан из Ксинга по имени Мэй Чан, прибывшую в Аместрис в поисках философского камня. Барри-мясник схвачен Мустангом, Хоукай и прапорщиком Фарманом. Братья Элрики возвращаются в Рашвелл, чтобы отремонтировать автоброню Эдварда. Там они знакомятся с Лингом Яо, принцем из Ксинга, приехавшим в Аместрис для изучения алхимии Запада. Телохранители принца, Фу и Лан Фан, нападают на братьев, в надежде добиться от них раскрытия тайны философского камня. Братьям удается заставить Линга и его команду отступить, после чего они сталкиваются с горожанами, рассерженными значительными разрушениями во время боя. Позже Линг находит Эда и Ала, рассказав, что ищет философский камень, с помощью которого надеется стать императором Ксинга. Братья, Уинри и их новые знакомые отправляются в Централ. Туда же уезжают Шрам, Йоки и Мэй Чан.

67
По следам боевых товарищей
После прибытия в Централ Линг арестован как нелегальный иммигрант. Ческа выдаёт информацию о деятельности Мустанга Зависти, принявшему облик капитана Фоккера. Армстронг сообщает Мустангу, что не смог рассказать братьям о смерти Хьюза. В свою очередь Мустанг решает обмануть Элриков, сообщив им, что Хьюз ушёл из армии. Однако вскоре братья узнают правду, столкнувшись с Росс. Тем временем Уинри посещает Грейсию и Элисию Хьюз, от которых узнаёт о смерти Хьюза. Эдуард и Альфонс приходят домой к Хьюзам, чтобы принести извинения, поскольку Эд винит себя в убийстве Хьюза. Грейсия призывает их идти дальше в своих поисках. Зависть придумывает план, чтобы остановить Мустанга, начавшего расследование смерти Хьюза. Согласно плану в убийстве обвиняют Марию Росс.

68
Хладное пламя
Барри-мясник, прочитав в газете статью о задержании Росс, совершает налёт на тюрьму, откуда вместе с Росс освобождает Линга Яо, который обещает помогать им. Барри говорит Росс, что она должна оставить Централ немедленно или её убьют. Эдвард и Альфонс, не верящие в виновность Марии, отправляются на её поиски, но натыкаются на Барри, который встал у них на пути, чтобы дать Росс возможность уйти. Убегающая Росс встречается с Мустангом. Вскоре Эд находит почти полностью сгоревшее тело и стоящего рядом Мустанга. Позже появляется Армстронг, который забирает Эдварда, говоря, что тот должен вернуться в Ризенбург.

69
Заносчивая длань маленького человека
Прибыв в Ризенбург, Эдвард и Армстронг встречают там лейтенанта Бреда, который сопровождает их по приказу Мустанга в Восточную пустыню. Там, на руинах древнего города Ксеркса, в котором зародилась алхимия, они обнаруживают живую Росс. Выясняется, что Мустанг сымитировал её смерть. Росс уезжает вместе с Фу в Ксинг. Эд исследует руины и встречает ишварских беженцев, от которых узнаёт, что родители Уинри во время войны в Ишваре лечили всех, независимо от расы, а убил их Шрам, которого перед этим Рокбеллы спасли от смерти. В Централе тело Барри, которое, лишившись души, превратилось в зомби, атакует Фармана и Барри. При помощи младшего лейтенанта Хавока им удается скрутить тело Барри. Неожиданно на Хоукай, которая была поблизости, нападает Обжорство.

70
Смерть бессмертных
Сержанту Фьюри удаётся спасти Хоукай, после чего вместе с Мустангом они побеждают Обжорство. Барри, возжелав непременно разделать собственное тело, преследует его. Мустанг и его команда, а также присоединившийся к ним Альфонс, отправляются вслед за Барри и попадают в Третью лабораторию, где разбиваются на две группы. Мустанг и Хавок попадают в засаду устроенную Похотью, в результате чего оба тяжело ранены. Затем Похоть рассекает на части Барри. Хоукай, полагая Мустанга мёртвым, вступает в бой с Похотью. Когда гомункул уже готова убить Ризу, появляется Мустанг и прожаривает Похоть до полного истощения философского камня. Потеряв способность к регенерации, она рассыпается в пепел. Эдвард возвращается в Ризенбург и на могиле матери встречает своего отца, Ван Хоэнхайма.

81
Кампания по уничтожению Ишвара
Много лет назад, Бертольд Хоукай, учитель Мустанга, умирая от болезни, попросил Роя позаботиться о его дочери Ризе, которой он нанёс на спину татуировку с подробностями своих исследований алхимии огня.
Эдвард возвращает Хоукай пистолет, который она дала ему, и признаётся, что не смог нажать на курок. Шрам требует от Марко рассказать правду о войне в Ишваре. В это же время Хоукай по просьбе Эда вспоминает прошлое.
Ишварская война затянулась на семь лет и тогда фюрер подписал приказ №3066 о зачистке Ишвара. Это серьёзно повлияло на судьбу многих государственных алхимиков и военных, включая Мустанга, Хьюза и саму Хоукай, в то время армейского снайпера. Были такие, как Зольф Дж. Кимбли по прозвищу «Багровый алхимик», которому так понравилось убивать, что он не смог остановиться и убил пятерых аместрийских офицеров, за что был приговорён к пожизненному заключению. Были и такие, как Армстронг, готовые воевать, но не способные убивать мирных жителей.
Марко открывает Шраму, что алхимики использовали пленных для получения философского камня, который позже Кимбли применил для истребления ишваритов. После того как аместрийцы применили философский камень, в войне наступил перелом и окончание зачистки стало лишь вопросом времени. Ишварский первосвященник предложил Брэдли прекратить убийства в обмен на его жизнь, но безуспешно. Когда война, наконец, закончилась, Мустанг решил, что станет новым фюрером, чтобы защитить людей, а Хьюз и Хоукай обещали ему помогать.
Мэй, разочаровавшись в Эдварде Элрике, влюбилась в его младшего брата. Зависть, принеся Марко еду, обнаружил в камере обезглавленный труп и слово «месть», написанное кровью на стене.

82
Обещание за 520 центов
Эд и Ал решают найти Мэй и выучиться алхимии Востока, которую не смог заблокировать Отец. Подчинённые Мустанга прощаются, разъезжаясь по военным базам. Мустанг напоминает Эдварду, что тот должен ему пятьсот двадцать центов, но Эд решает отдать деньги, когда Рой свергнет фюрера и установит в стране демократию. Мустанг решает вступить в контакт с генералом Грумманом, командующим Восточной армии. Фу потрясен тем, что Лан Фан потеряла
руку. К доктору Кноксу приходят жена и сын, с которыми он расстался после пережитого на Ишварской войне, боясь навредить им. Подозревая, что Марко бежал вместе с Шрамом, Зависть освобождает Кимбли из тюрьмы и даёт ему задачу вернуть доктора и убить Шрама. Шрам своей алхимией уродует лицо Марко так, чтобы его не могли опознать. После этого Шрам со своей командой отправляется на север, где он спрятал записи своего брата.

83
Сын фюрера
Путая преследователей, Шрам едет вдвоём с Йоки на Запад, отправив Мэй и Марко на Север. Грумман в Централе тайно встречается с Мустангом. Братья Элрики узнают, что Мэй уехала на Север и решают отправиться за ней. Армстронг даёт Эдварду рекомендательное письмо к своей сестре, генералу Оливии Армстронг, командиру крепости Бриггс на Севере. Эд и Ал, ища в библиотеке информацию об алхимии Ксинга, встречают приёмного сына фюрера, Селима Брэдли, который приглашает братьев к себе домой, где они знакомятся с женой фюрера, а позже к ним присоединяется сам Кинг Брэдли. После встречи братья наконец-то отправляются на Север. Между тем, Шрам и его сообщник сбегают из поезда, идущего на Запад, а Кимбли пытается угадать их следующий ход.

84
Северная стена Бриггса
Кимбли удаётся догнать поезд, на котором едут Шрам и Йоки. Ишварит и «Багровый алхимик» узнают друг друга. Шраму удаётся ранить Кимбли. Между тем, Мэй и Марко продолжают свой путь на Север. Эдвард и Альфонс, приехав на Север, сталкиваются с командиром патрульных Бриггса капитаном Бакканиром, который доставляет их к Оливии Армстронг. Мэй и Марко находят записи исследований старшего брата Шрама.

85
Снежная королева
Эдвард узнаёт, что его автоброня не подходит для Севера с его морозами. Оливия Армстронг расспрашивает Элриков о цели их прибытия. Братья отвечают полуправдой, рассказав о своих поисках информации об алхимии Ксинга, с помощью которой намерены лечить людей. Генерал заинтересовалась восточной алхимией, надеясь использовать её для войны с империей Драхма. Братьев поручили майору Майлзу, адъютанту генерала Армстронг, наполовину ишвариту, наполовину аместрийцу. Элрики встречают в крепости Фармана. Неожиданно на самый нижний уровень Бриггса прорывается гомункул Лень, поразивший всех своей неуязвимостью. Эд, показав свою осведомлённость о гомункулах, отказывается отвечать на вопросы о них. Генерал Армстронг находит способ пленить Лень.

86
Форма этой страны
Солдатам Бриггса удается захватить Лень, заморозив его. Генерал Армстронг хочет узнать от Элриков больше о гомункулах. Кимбли, который после ранения от Шрама находится в госпитале, поспешно исцеляют с помощью философского камня. Мэй учит Марко восточной алхимии. Братья, Оливия Армстронг и Бакканир спускаются в тоннель, который рыл Лень. Эд и Фарман приходят к выводу, что тоннель нужен как часть гигантского круга преобразования с целью получения философского камня и что Аместрис был создан именно для этой цели. Генерал Рэйвен в сопровождении Кимбли приезжает в крепость Бриггс и, решив вовлечь Оливию Армстронг в заговор военной верхушки,
рассказывает ей о фюрере, истории Аместриса и Бессмертной армии. 

87
Семейный портрет
Хоэнхайм вспоминает о том, как оставил свою семью, сетуя, что его тело переживёт жену и сыновей. Между тем, солдаты Бриггса начинают исследовать тоннель, где их атакуют таинственные тени. Генерал Рэйвен приказывает
Оливии Армстронг отпустить Лень обратно в тоннель и запечатать его. Выполнив приказ, Армстронг убивает Рэйвена. После этого Оливия через заранее подготовленный вход в тоннель отправляет Бакканира на поиски пропавших солдат. Кимбли приводит Уинри Рокбелл в тюрьму, где находятся братья Элрики, давая им понять, что девушка будет у него заложницей. Шрам и Йоки воссоединяется с Мэй и Марко. Мустанг с помощью мадам Кристмас устанавливает связь с Бриггсом.

88
Первый гомункул
Уинри устанавливает Эдварду новую автоброню, приспособленную для использования в условиях Севера. Кимбли разделяет братьев. Поисковый отряд Бакканира находит в тоннеле останки солдат и лишь двоих выживших, которые просят их не включать свет, так как он привлечёт монстра. Риза Хоукай доставляет в резиденцию фюрера документы и понимает, что с Селимом Брэдли что-то не так. Той же ночью приёмный сын фюрера, всё поняв, признаётся Хоукай в том, что он первый из семи гомункулов. Он решил не убивать Ризу, пообещав, что будет приглядывать за ней, притаившись в её тени. Кимбли требует от Эдварда принять участие в охоте на Шрама и Марко, обещая взамен отдать философский камень. Рассказав всё Альфонсу и Уинри, Эд соглашается помочь Кимбли, хотя, и не намерен использовать камень. Братья отправляются на поиски Шрама, Уинри решает сопровождать их.

89
Битва в Бадзукуле
Хоукай не решается рассказать Мустангу о Гордыне, опасаясь слежки. Кимбли отправляется на поиски Шрама в заброшенный горняцкий город Бадзукуле. Элрики и Уинри сбегают от охранников Кимбли и находят Мэй, Марко и Йоки. Последний при виде ненавистного Эда вспоминает, как из-за него был с позором уволен из армии и подвергся уголовному преследованию. Шрам вступает в бой с химерами Джерсо и Зампано, которых привёз Кимбли. Эд и Ал спасают Шрама от химер. Появляются Уинри и Майлз. Вскоре к зданию, где они прячутся, подходят Кимбли и его солдаты. Шрам берёт Уинри в заложники. Команда Бакканира возвращается из тоннеля вместе с выжившими, а в крепость Бриггс прибывает делегация из Центрального штаба.

90
Сон наяву 
Столкнувшись с убийцей своих родителей, Уинри решает не мстить и перевязывает раны Шрама, говоря, что поступает так же, как сделали бы её родители. Майлз объясняет Шраму, почему он, наполовину ишварит, служит в армии Аместриса. Мэй и Марко говорят, что для расшифровки записей им нужна помощь Шрама. Майлз предлагает всем укрыться в крепости. Альфонс предлагает химерам помочь им в обмен на помощь в возврате их человеческих тел. Йоки, ранее управлявший шахтами, обещает вывести всех из города через шахты. Уинри, чтобы обмануть Кимбли, придумывает уловку с собственным похищением. Шрам и остальные уходят под землю. Элрикам, Кимбли, Майлзу и солдатам приходится задержаться в Бадзукуле, так как началась метель. Майлз получает сообщение из крепости о том, что Оливия Армстронг вызвана в Централ, а в Бриггсе новый командир. Теперь Шраму и другим появляться в крепости опасно. Несмотря на пургу, Альфонс отправляется предупредить Шрама об опасности. По дороге он неожиданно для себя попадает к Вратам Истины, где видит своё тело. Ал понимает, что доспехи отторгают его душу, которую зовёт его тело. Отец строит планы с участием Эдварда, Альфонса, Хоэнхайма, Изуми и Мустанга.

101
Переворот в Централе
Команду Мустанга и заложницу спасают ишвариты. Между тем, солдаты Бриггса во главе с Бакканиром вступают в бой с армией Централа. Команда Мустанга окружена и испытывает нехватку боеприпасов, но на помощь им приходят Мария Росс и Ребекка Каталина, давняя подруга Хоукай, тоже снайпер. Они доставили оружие и боеприпасы, получив их от Жана Хавока, который после увольнения из армии по причине инвалидности занялся семейным бизнесом.
Группа Эдварда, воспользовавшись хаосом, наступившим в Централе, проникает в Третью лабораторию, откуда они через подземный ход намерены попасть в Центральный штаб. Группа разделяется: Эд, Шрам, Дариус, Джерсо и Зампано идут в одном направлении, а Хоэнхайм и Лан Фан - в другом. В это время один из генералов-избранных решает оживить Бессмертную армию, несмотря на предупреждение о незавершённости экспериментов по вливанию душ.

102
Бессмертная армия
Вместо армии непобедимых солдат Аместрис получил толпу кровожадных зомби. Именно с ними сталкивается группа Эдварда, открыв дверь в подземный ход из Третьей лаборатории в Центральный штаб. Лень нападает на Оливию Армстронг.
Гордыня не просто так стучал по шлему Альфонса, а отправлял сообщение азбукой Морзе. Получив его, на помощь гомункулу прибывает Кимбли. Напав на Хейнкеля и ранив его, он освобождает Гордыню.
Мэй спускается под землю, где её атакуют солдаты-гомункулы. Зависти удаётся поглотить часть Бессмертной армии, благодаря чему он возвращается к своей обычной форме. Алекс Армстронг присоединяется к борьбе своей сестры против Лени. Алу приходится пожертвовать ногами, чтобы помочь Хейнкелю, который затем отдаёт ему философский камень, потерянный Кимбли в Бадзукуле. Альфонс использует его, чтобы восстановить ноги и вступить в бой с Гордыней и Багровым алхимиком.

103
Объединённые усилия
Альфонс использует философский камень для боя с Гордыней и Кимбли. Ему удаётся вновь пленить гомункула, но Багровый алхимик пускает в ход свой камень.
Брат и сестра Армстронги начинают брать верх над гомункулом, но в это время Лень показывает свою истинную силу, демонстрируя, что он самый быстрый из гомункулов.
Гордыне удается захватить Ала, но Хейнкель, исцелённый Марко, наносит смертельный удар Кимбли. Неожиданно на поле боя появляется Йоки, преодолевший свою трусость. Раздобыв машину, он увозит Альфонса и других в Централ. Гордыня поглощает смертельно раненного Кимбли.
Алексу Армстронгу удаётся насадить Лень на шип, но он и Оливия подвергаются нападению зомби. Мэй приходится убегать и от Зависти, и от солдат-гомункулов. Мустанг и Хоукай приходят на помощь группе Эдварда, сражающейся против зомби из Бессмертной армии.

104
Пламя мести
Люди Мустанга, взяв под контроль радиостанцию Централа, выпускают в прямой эфир интервью с женой Брэдли. С помощью радио и ишваритов, разносящих по городу последние новости, жителей города убеждают, что Мустанг ведёт бой против военной верхушки, задумавшей свергнуть фюрера. Это даёт повстанцам поддержку со стороны граждан. Солдаты Бриггса начинает атаку на Центральный штаб. С помощью Мустанга группе Эдварда удаётся уничтожить зомби. Мэй и гонящийся за ней Зависть проваливаются с верхних уровней в подземный зал, где сталкиваются с Мустангом, Эдом и другими. Зависть подтверждает, что он убил Хьюза. Взбешённый Мустанг, давно мечтавший отомстить за смерть друга, отправляет группу Эдварда вперёд, а сам остаётся жечь Зависть. Эд, обеспокоенный тем, что Мустанг может в конечном итоге быть поглощён своей ненавистью, решает вернуться. Зависть не может противостоять Мустангу и пытается сбежать от него. Увидев Хоукай, Зависть придумывает план. Чуть позже Рой и Риза встречают друг друга и продолжает путь вдвоём, но Хоукай неожиданно наводит пистолет на Мустанга.

105
Обратная сторона пламени
1909 год. По окончании Ишварской войны Хоукай просит Мустанга сжечь кожу на её спине, чтобы уничтожить вытатуированные на ней записи отца об огненной алхимии. Рой не сразу, но соглашается.
1915 год. Хоукай разоблачает Зависть и пытается расстрелять его. Гомункулу всё же удаётся пленить её, но появляется настоящий Мустанг и начинает беспощадно жечь Зависть, пугая своей ненавистью Хоукай. Не выдержав огня, гомункул принимает свой изначальный жалкий вид. Рой хочет добить Зависть, но Хоукай наводит на него пистолет, требуя остановиться. Появляются Эдвард и Шрам. Элрик отбирает у Мустанга Зависть. Рой угрожает Стальному алхимику огнём, требуя вернуть гомункула. Все трое пытаются убедить Мустанга не вступать на путь жестокости и убийств, ведь Аместрисом не может управлять человек, охваченный злобой. Хоукай готова застрелить Мустанга, а после победы умереть. Рой не хочет терять Ризу и уступает. Гомункул возмущён поведением людей, которые не хотят следовать своим инстинктам, и пытается спровоцировать их, напоминая обо всем, что они сделали друг другу. Эд определяет, что причина ненависти Зависти к людям, в том, что он завидует их способности продолжать жить дальше, несмотря на все невзгоды, помогая друг другу. Униженный и оскорбленный поражением от людей, своим нынешним жалким видом и тем что «какой-то мелкий даже по меркам людей» понимает его, Зависть совершает самоубийство, вырывая и уничтожая свой философский камень.
Брат и сестра Армстронги по-прежнему дерутся с Ленью. Изуми прибывает в Централ, чтобы участвовать в государственном перевороте вместе с солдатами Бриггса. В другом месте Хоэнхайм противостоит Отцу.

106
Образ жизни взрослых
Армстронги с трудом отбиваются от Лени и зомби, но на помощь им приходят Изуми и Зиг. Алекс и Зиг совместно убивают Лень, после чего могут заняться истреблением солдат-гомункулов. Хоэнхайм борется с Отцом под землей. В разгар битвы выясняется, что Отец не в состоянии принять в себя философский камень Хоэнхайма. Солдатам Бриггса удается сломить сопротивление врага и захватить Центральный штаб. Но праздновать победу рано. В Централе появляется Брэдли-Гнев, выживший после взрыва своего поезда. Он собирается покарать мятежников и вернуть себе штаб.

107
Возвращение фюрера
Выясняется, что Хоэнхайм, в отличие от Отца, побеседовал со всеми душами ставшими частью его философского камня. Они стали его союзниками, а когда Отец попытался забрать философский камень у Хоэнхайма, проникли в его тело, чтобы уничтожить изнутри. Однако Отец выживает, потеряв тело, и принимает свою истинную форму: бесформенное существо, состоящее из тёмной материи, глаз и рта. Брэдли начинает свою атаку на штаб, в одиночку истребляя всех, кто пытается ему противостоять. Выжить удается только Бакканиру, потерявшему свою руку-автоброню. Когда Гнев достигает главных ворот, его встречает Жадность. Бакканир рискует своей жизнью и ценой тяжёлой раны оставляет Брэдли без меча. Гневу приходится вооружиться кинжалами, хотя это не снижает его боеспособности. В это время оставшиеся в живых солдаты Бриггса пытаются отбить штурм солдат Централа, воодушевлённых появлением фюрера. На помощь Жадности-Лингу приходит старик Фу.

108
Вечный покой
Один из генералов-избранных, попав в плен к Изуми и Оливии, рассказывает о планах принести в жертву многих граждан Аместриса ради обретения бессмертия и власти над миром. Эдвард, Шрам, Мустанг и Хоукай встречают в подземелье доктора с золотым зубом, того самого, который создал Гнева. На них нападают неудачные кандидаты на роль фюрера. В это время Гнев сражается с Жадностью и Фу. Брэдли отбирает у старика его меч, а затем наносит ему тяжёлую рану. Фу, понимая, что умирает, бросается на Гнева обвязавшись взрывными шашками. Брэдли обезвреживает их и добивает старика. В это время Бакканир, пользуясь тем, что его заслоняет Фу, поражает Гнева мечом прямо через тело старика, что позволяет Лингу выбить волшебный левый глаз фюрера. Появляется Лан Фан, став свидетелем смерти своего деда. В это время Альфонс, Хейнкель, Марко и Йоки, бросив разбитую машину, изо всех сил бегут к штабу. Доктор с золотым зубом завершает малый круг преобразования, а с его помощью активирует соединяющий все пять исследовательских лабораторий Централа большой. Тот поглощает Эдварда, Альфонса и Изуми.

109
Ценные жертвы
Жадность при помощи солдат сбрасывает раненного Брэдли в крепостной ров с водой. Умирающий Бакканир просит Линга защищать ворота. Обезумев из-за смерти Фу, Линг использует Абсолютный щит Жадности, чтобы уничтожить всех врагов собравшихся перед воротами. Армстронги вместе с Зигом и солдатами идут вниз, в подземелья. Эдвард, Изуми и Альфонс, вновь потерявший сознание, появляются в логове Отца, где обнаруживают, что Хоэнхайм почти поглощён своим врагом. Четыре ценные жертвы на месте, пятой должен стать Мустанг, но для этого ему надо совершить преобразование человека. Рой отказывается, и пленённой Хоукай перерезают горло по приказу доктора с золотым зубом. Тот обещает Мустангу, что спасёт ей жизнь с помощью философского камня, но только если Рой выполнит преобразование человека.

110
Померкнувший свет
Мустанг отказывается выполнять требование доктора с золотым зубом. Внезапно на доктора сверху нападает химера Джерсо. Вслед за ним появляются Мэй, Зампано и Дариус. Они освобождают Мустанга и Шрама, а Мэй исцеляет Хоукай. Затем Гнев и Гордыня заставляют Мустанга открыть Врата истины, преобразовав золотозубого доктора. Смертельно раненный, оставшийся без абсолютного зрения Гнев вызывает желающих на бой, и Шрам принимает вызов. Мустанг проходит через Врата Истины и появляется в логове Отца, где выясняется, что за открытие Врат ему пришлось расплатиться своим зрением. Вместе с ним появляется Гордыня. Мэй, взорвав потолок, проникает в логово Отца. Альфонс, так и не пришедший в сознание, стоит перед воротами, готовый слиться со своим телом, но, осознав, как то ослабло за время пребывания за Вратами, и придя в отчаяние от того, что будет не в состоянии сражаться вместе с другими, Ал решает пока оставаться в своих доспехах. Он проходит через Врата и приходит в себя в логове Отца. Все пять ценных жертв готовы.