Одной из самых заметных киноролей Бориса Клюева стала роль графа Рошфора, доверенного лица кардинала Ришелье в музыкальном телефильме «Д’Артаньян и три мушкетёра». Не все знают, что изначально режиссёром Георгием Юнгвальд-Хилькевичем поддерживалась кандидатура Михаила Боярского на роль графа Рошфора. Но по решению Госкино состоялось утверждение Клюева на эту роль, хотя режиссёру его кандидатура не нравилась. Однако же сам актёр остался очень недоволен работой с Юнгвальд-Хилькевичем, поделившись своим мнением в одном из интервью: «Я считаю, что Юнгвальд-Хилькевич не очень талантливый человек. И картина получилась благодаря тому, что была хорошая компания, мы все были очень молоды, плюс замечательная музыка Максима Дунаевского». В процессе съёмок Клюеву самому пришлось поработать не только над характером графа Рошфора, но и над его внешностью. Изначально гримеры хотели приклеить ему бороду. Но артист настоял на том, чтобы они оставили лишь тонкую линию усов и бородку клинышком.
На съёмках Михаил Боярский получил серьёзную травму, когда снимали сцену Марлезонского балета в Одесском оперном театре. Граф Рошфор, которого играл Борис Клюев, был задуман как человек, который никогда не вынимает шпаги из ножен, поэтому его обучением практически не занимались. Но в одной сцене Клюев не выдержал и выхватил клинок. В результате его шпага проткнула нёбо Боярскому и буквально сантиметр не дошла до мозга. К счастью для Боярского, всё обошлось без тяжёлых последствий. Сам Борис Клюев прокомментировал ситуацию следующим образом:«Снимали сцену тройного поединка на шпагах д’Артаньяна, Рошфора и де Жюссака, которого играл Владимир Балон. Мы должны были скрестить шпаги на лестнице, снимали в Одесском оперном театре. Когда репетировали, все шло замечательно, но на съёмках, ускорили темп фехтования. И вот Миша Боярский, сильно замахнувшись клинком, направил мою шпагу прямиком себе в лицо. Она выбила ему зуб и оцарапала горло. Однако он, как истинный профессионал, продолжил сниматься. Потом я узнал, что эта травма весьма распространена у фехтовальщиков».

Фильмография

1967 — Война и мир — французский солдат (массовка
1968 — Каратель — патрульный
1968 — По Руси — член социалистического кружка (нет в титрах)
1969 — Красная палатка (фильм) — репортер
1970 — Крушение империи — Шульгин
1971 — Рудобельская республика — Телецкий
1971 — Вчера, сегодня и всегда
1972 — Земля, до востребования — Хименес
1977 — Гроза — Кудряш
1977 — Хождение по мукам — князь Бельский
1978 — Д’Артаньян и три мушкетёра — граф Рошфор
1980 — Приключения Шерлока Холмса и доктора Ватсона — Майкрофт Холмс
1980 — Эскадрон гусар летучих — французский офицер (в титрах указан как «Ю. Клюев»)
1980 — Скандальное происшествие в Брикмилле — секретарь Кэттла
1982 — Никколо Паганини — Фердинандо Паэр
1982 — Тем, кто остается жить — Хренников
1983 — Подросток — Афердов
1983 — Жизнь Берлиоза — Рихард Вагнер
1984 — ТАСС уполномочен заявить — Сергей Дмитриевич Дубов / сотрудник КГБ (5 серия)
1985 — Сестра моя Люся
1985 — Иван Бабушкин — иностранный журналист
1986 — Соучастие в убийстве — Олифер
1986 — Наградить (посмертно) — новый хозяин дома Сосниных
1986 — Покушение на ГОЭЛРО — Ганс Мюллер
1986 — Конец операции «Резидент» — атташе
1986 — Михайло Ломоносов — Григорий Орлов
1986 — Приключения Шерлока Холмса и доктора Ватсона: Двадцатый век начинается — Майкрофт Холмс
1986 — Баллада о старом оружии — командир взвода СС
1987 — Моонзунд — Гарольд Карлович фон Грапф
1987 — Отряд специального назначения — гауптштурмфюрер Мартин Геттель
1987 — Конец Вечности — социолог Кантор Вой
1988 — Клад — управляющий
1989 — Криминальный квартет — главный инженер
1989 — Приговоренный — милиционер, ранивший главного героя
1990 — Очарованный странник — граф
1990 — Царская охота — адмирал Грейг
1990 — Футболист — Альберт
1991 — Рукопись
1991 — Сократ — Критий
1990 — …По прозвищу «Зверь» — заключённый
1991 — Гений — Архипов
1991 — Окно напротив — Торвальд
1991 — Попугай для сыщика — Торвальд
1992 — Разыскивается опасный преступник — Виктор
1992 — Только не уходи… — начальник
1992 — Как живёте, караси? — Художник
1992 — Сны о России — русский морской офицер
1992 — Сумасшедшая любовь — начальник репортёра
1993 — Аляска Кид — Бродый
1993 — Раскол — великий князь Сергей
1993 — Грех. История страсти — Отто
1995 — На углу, у Патриарших — Колесников
1997 — Шизофрения — Лозовский (аллюзия на Б. Березовского)
1997 — Графиня де Монсоро — герцог де Гиз
1997 — Королева Марго — герцог де Гиз
1998 — Самозванцы — отец погибшей
1999 — Мумия в наколках — Рубашкин
1999 — Д. Д. Д. Досье детектива Дубровского — Шнурков, заместитель директора ФСБ
2000 — Марш Турецкого — Старевич
2000 — Убойная сила — Крамской
2000 — Новый год в ноябре — дрессировщик
2000 — Воспоминания о Шерлоке Холмсе — Майкрофт Холмс
2001 — Блюстители порока — Джейкоб
2001 — Львиная доля — директор ФСБ
2001 — Сыщики — адвокат
2001 — Удар Лотоса — Гомес
2002 — Каменская 2 — Мельников
2002 — Русские амазонки
2003 — Пан или пропал — Влад Яхимек
2004 — Стилет 2 — Ковалёв
2004 — Даша Васильева 2 — Семёнов
2004 — Тариф на любовь — Николай Алексеевич, отец Юли
2004 — Слепой — Поливанов
2004 — Бальзаковский возраст, или Все мужики сво… — Спартак Петрович
2005 — Любовь моя — Андрей Строев
2005 — Ой, мороз, мороз! — генерал-майор
2005 — Умножающий печаль — Гвоздев
2005 — Сыщики районного масштаба
2005 — Парижская любовь Кости Гуманкова — Месье Плюш
2005 — Казус Кукоцкого — профессор Гансовский
2005 — Девять неизвестных — генерал Творожников
2006 — Всё смешалось в доме — Сергей Малюков, владелец банка
2006 — Защита Красина — Пётр Сосновский
2007 — 07-й меняет курс — президент США
2007 — Вопреки здравому смыслу — адвокат Игорь Антонов
2007 — Ниоткуда с любовью, или Весёлые похороны — Лёва
2007 — Белка в колесе — Валентин
2007 — Бешеная — губернатор Кожемякин
2008 — Общая терапия — главврач Михаил Ильич Тышкевич
2008 — Кровные узы — Стрелецкий
2008 — Сердцеедки — Альберт Михайлович Зуев
2008 — Сыщики районного масштаба 2 — Осмоловский
2008 — Солдаты 15 — проверяющий полковник
2009 — Братаны — Царёв
2009 — И была война — Анищенко Борис Владимирович
2009 — По следу Феникса — Рудаков Иван Борисович, прокурор
2009-2014 — Воронины — Николай Петрович Воронин, отец Кости и Лёни, муж Галины Ивановны
2009 — Предлагаемые обстоятельства — Альберт Николаевич, отец Лизы
2010 — Банщик президента, или Пасечники Вселенной — генеральный продюсер
2010 — Блюз-кафе
2010 — Братаны-2 — Царёв
2010 — Общая терапия 2 — Михаил Ильич Тышкевич
2010 — Дом образцового содержания — Леонид Алексеевич Верещагин, следователь НКВ
2011 — Земский доктор. Продолжение — Вячеслав Геннадьевич Коробнев
2011 — Улыбка судьбы — Владимир Георгиевич
2011 — Земский доктор. Жизнь заново — Вячеслав Геннадьевич Коробнев
2012 — Уланская баллада — Аракчеев
2012 — Часовщик — друг киллера
2012 — Товарищи полицейские — Алексей Романович Коротыгин
2013 — Земский доктор. Возвращение — Вячеслав Геннадьевич Коробнев
2013 — Вероника. Беглянка — Романченко
2013 — Бальзаковский возраст, или все мужики сво… 5 лет спустя — Спартак Петрович
2013 — Людмила — импресарио в Америке
2013 — Семейные обстоятельства — Герман Борисович Романов
2013 — Трое в Коми — Владимир Сергеевич
2013 — Братья по обмену — Олег Дмитриевич Чумаков
2013 — Улицы разбитых фонарей 13 — генерал Мерзлякин Алексей Николаевич, начальник ГУ МВД