3 эпизод – «То, что останется»
Милые будни новой реальности эпохи динозавров продолжаются. Но как же без проблем? От научной станции, расположенной в джунглях, трое суток нет никаких вестей. Тогда Тейлор берёт с собой Элизабет чтобы съездить и проверить, что там могло случиться.

Между тем, попадая на станцию, Тейлор и Элизабет видят странную картину – сотрудники растеряны и несут околесицу, а один из них вообще исчез. Похоже, никто не понимает, где он на самом деле находится. Получив доступ к видеозаписи, сделанной начальником станции, Элизабет понимает, что дело в странном вирусе, поражающем людей таким образом, что они постепенно начинают терять память – год за годом, оказываясь в прошлом, а со временем просто впадают в ступор. Поскольку вирус вероятнее всего очень заразен, то Тейлор объявляет на станции карантин, пока Элизабет пытается найти против него вакцину.

Джим Шеннон, встревоженный положением дел на станции, решает поехать к жене. Малькольм едет с ним. Когда они прибывают на станцию, Элизабет встречает их с ружьём и не узнаёт своего мужа, зато отлично узнаёт Малькольма, считая, что сейчас как раз то время, когда они встречаются. Малькольм понемногу выясняет ситуацию и просит Джима пока не говорить ничего Элизабет о том, кто он ей, потому что она совершенно забыла и мужа и детей, но она должна им помочь найти лекарство.

В это время Тейлор, считая, что его местонахождение - Сомали 2137 года - во время военных действий, не узнавая ни местности, ни людей сбегает со станции и, попав в Терра Нову, начинает вести себя агрессивно.

Похоже, что вирус заражает всех, кроме Джима, накануне подхватившего простуду. Тем временем Малькольм и Элизабет приходят к выводу, что причина не в вирусе, а в каких-то генетических экспериментах, секретно проводившихся на станции...

А вот Джош, не обращающий внимания на нежные взгляды привязавшейся к нему Скай, хочет попытаться помочь пробраться в Терра Нову своей любимой девушке, оставшейся в 2149-м. И для этого обращается к человеку, связанному с «шестыми» - группировкой, отколовшейся от основного поселения.

5 эпизод – «Устав»
Патрульный Терра Новы Фостер погибает от нападения динозавра. Джим подозревает, что нападение было спровоцировано, а, следовательно, произошло умышленное убийство. Такого в Терра Нове ещё не случалось.

Шеннон начинает расследование. Оказывается, убитый носил с собой фото какой-то женщины, с которой он встречался. Однако чтобы достать это фото приходится устраивать охоту на динозавра, который убил Фостера, поскольку устройство с личными данными динозавр просто проглотил.

По найденной фотографии находят женщину, с которой встречался солдат. Ей оказывается замужняя женщина по имени Ребекка. Её пожилой муж тут же признаётся, что убийство было совершено им – из ревности.

Тейлор в растерянности. Ему придётся принять тяжёлое решение, однако Устав Терра Новы бескомпромиссен. После короткого общественного суда, мужа Ребекки, Ховарда Милнера, изгоняют за периметр, снабдив оружием и кое-какими припасами, а это фактически то же самое, что вынести смертный приговор.

Однако поговорив с женой, Джим начинает сомневаться, а не взял ли Ховард на себя чужую вину. Он отправляется в джунгли, разыскивает Ховарда и выясняет, что тот подумал, что убийство совершила его жена, которую он любит до безумия, и потому взял вину на себя.

Возвратившись с Ховардом в Терра Нову и поговорив с Ребеккой, Джим понимает, что она тут тоже не причём и следствие завело его в ошибочном направлении.

Джим продолжает расследование и выясняет, что Фостер был завсегдатаем в баре Бойлена и часто играл там на деньги. Исследовав бухгалтерские записи, следствие выходит на настоящего убийцу Фостера – солдата, который проиграл тому крупную сумму и потому решил убить того, чтобы не платить ему денег. В ярости Тейлор устраивает спектакль перед солдатом, чтобы вырвать у того признание, и оставляет его одного в джунглях – без оружия.

Тем временем яйцо динозавра, оставленное на месте преступления, оказывается «живым», однако зародышу требуется операция, чтобы он выжил, и Элизабет проводит такую операцию к радости Зои, наблюдающей за рождением настоящего динозаврика.

Джошу, мечтающему забрать в Терра Нову свою девушку, приходится пойти на встречу с Миррой, которая требует от него обещание – выполнить однажды её просьбу взамен на возможность передачи сообщения в 1149-й год.

7 эпизод – «Доказательство»
В Терра Новее событие – возвращение полугодичной экспедиции из джунглей, возглавляемой учёным Кеннетом Хортеном. Этот учёный – кумир Мэдди, увлекающейся историей древнего мира. Она радостно отправляется знакомиться с известным ученым, и он даже соглашается принять её услуги по сортировке и классификации экспедиционных находок.

Однако по мере общения со своим новым наставником, Мэдди начинает замечать, что с ним что-то не так. Он не помнит, о чём писал в своих книгах и с кем ходил в экспедицию много лет назад. Всё, конечно. Может объяснить инсульт, который якобы с ним случился не так давно. Однако профессор старается уклониться и от медицинского обследования. Мэдди вспоминает о письме, которое когда-то прислал ей Хортен в ответ на её письмо, написанное на бумаге чернилами. Хортен просит принести ему письмо. Однако когда Мэгги сличает автограф, данный ей Хортеном, и подпись на письме, оказывается, что они – не идентичны.

Тем временем пришло время Джошу выполнить обещание, данное Мире – достать лекарство для болеющих в лагере «шестых». Лекарство – сильно действующий наркотик, который находится под замком, и чтобы его выкрасть, Джошу придётся украсть у матери электронный ключ.

Получив от Мирры доказательства что она не обманывает насчет того что его девушка прибудет со следующим потоком в Терра Нову, Джош совершает ограбление. Однако пластиковый ключ, изготовленный Бойленом по пропуску его матери не срабатывает, и Джошу приходится открывать замок, выстрелив в него из бластера и получив сильные синяки из-за отдачи оружия.

Когда обнаруживается пропажа, расследованием занимается Джим Шеннон – отец Джоша, а мать сокрушается из-за пропажи лекарства, благодаря которому поддерживалась жизнь одной из её пациенток. Джош понимает, что допустил страшную ошибку.

Мэдди тем временем проводит собственное расследование насчёт Хортена. Но у неё нет доказательств, кроме обрывков её письма, которое она нашла сожжённым у Хортена в мусорной корзине, и потому она пытается найти что-то на него самостоятельно. И это едва не стоит ей жизни, когда Хортен убеждается в том, что его подмена раскрыта. На самом деле настоящий Хортен был убит его помощником, который, сделав операцию, подменил собой выдающегося учёного, чтобы проникнуть в Терра Нову.

9 эпизод - «Теперь ты меня видишь»
Натаниэль Тейлор запрещает всем покидать базу, однако сам отправляется в одиночку в джунгли. Его цель – отыскать наскальные рисунки своего сына Лукаса, чтобы понять насколько тот действительно далеко продвинулся в работе над двусторонним порталом.

Однако в джунглях его словно поджидала Мира. Она застаёт Тейлора врасплох и берёт его в плен, намереваясь отвести в свой лагерь.

В Терра Нове Джим Шеннон замещает Тейлора. Вместе с Марком, который теперь вдвойне робеет перед потенциальным тестем, ставшим ещё и его непосредственным начальником, Шеннон обнаруживает сигнал, которым обменивается кто-то из шестых, с кем-то из Терра Новы. Обнаруживая источник ответного сигнала в виде солнечного зайчика, они бросаются на поиски шпиона. Однако на месте никого не застают, лишь капля крови плавает в жидкости, оброненная сигнализатором.

А сигналы подавала не то иная как Скай – любимица Тейлора. Шеннон забирает жидкость с кровью, чтобы попробовать установить предателя по анализу ДНК.

А в джунглях в это время Тейлор и Мирра меняются ролями. Теперь Мирра – пленница Тейлора и он хочет забрать её с собой. Однако приближается ночь, и на них начинает охоту пара молодых динозавров, облюбовавших себе эту территорию. Тейлору и Мире приходится объединиться, чтобы защитить свои жизни.

Скай выбирается из джунглей, чтобы доставить сведения в лагерь шестых и здесь открывается причина её предательства. Оказывается у шестых (и только у них) есть лекарство, поддерживающее жизнь её матери, которую давно считают погибшей.

Мирра и Тейлор, сплотившись против единого врага, понимают, что у них много общего и на самом деле, при иных обстоятельствах, они могли бы отлично сотрудничать. Тейлор так и говорит: "Где-то есть параллельный мир, где мы союзники".

Скай, придя на дежурство в больницу, уничтожает собственный образец крови прямо посреди анализа на ДНК. Однако анализ успевает установить, что кровь принадлежит женщине и круг подозреваемых сужается до 47-ми женщин.

Маленькой Зои приходится выпустить своего питомца – маленького динозаврика на волю, чтобы он сумел адаптироваться к жизни в джунглях.

11 эпизод часть 1 – «Оккупация»
Итак, в 2149-м году Лукас с наёмниками и нанимателями готовятся к захвату Терра Новы. А здесь Тейлор готовится к достойной встрече. При этом в Терра Новее никто не знает, кто появится из открытого портала – новая 11-я партия переселенцев или армия захватчиков. Уничтожить портал нельзя, потому что в таком случае временной проход может открыться в непредвиденном месте.  На всякий случай Тейлор организовывает защиту Периметра и собирает войско вокруг портала в момент прибытия гостей.

Через портал начинают прибывать переселенцы, в их числе и Кара - девушка Джоша. Внезапно из портала выходит человек, на котором установлена бомба и взрывается, уничтожив портал. Последнее что видит Шеннон, отброшенный взрывной волной – это дым и раненых людей.

Джим, у которого случилась контузия из-за взрыва, очнулся в госпитале и сразу не понял где он и что с ним. Он выходит из клиники и видит на территории кучу вооружённых солдат и следы разрушений. Его отыскивает Элизабет и приводит домой. Она рассказывает о том, что прошло уже три дня с момента захвата Терра Новы. После взрыва портала, он открылся возле колонии и, несмотря на сопротивление, лейтенанту Вашингтон пришлось сдать город захватчиками из-за больших потерь – погибло 26 человек. При взрыве портала так же погибла девушка Джоша, и теперь он винит себя в её гибели. Ведь если бы он не вызвал её, она была бы жива.

Тейлор с небольшим отрядом скрылся в джунглях, но у них нет никакой связи с Терра Новой. Об этом рассказывает Джиму Вашингтон в баре Бойлена, наполненном наёмными солдатами-убийцами.

Лукас с наёмниками принесли с собой новый терминал, чтобы наладить двустороннюю связь и перекачивать в будущее полезные ископаемые новой земли, однако из-за нападения карнотавров, терминал повредился и теперь Малькольм ремонтирует его, принуждаемый к этому Лукасом.

Шеннон притворяется глухим и контуженным и, полагая, что он повредился умом, его оставляют в покое. Элизабет, извлекая очередную пулю из солдата, убитого людьми Тейлора, обращает внимание на какие-то надписи, нацарапанные на ней. Шеннон догадывается, что это – координаты отряда, прячущегося в джунглях, и решает разыскать Тейлора.

Начинается жёсткая борьба с захватчиками, в которой Шеннон выступает связным, устанавливая маяки и прослушки на машины оккупантов.