3х01
Под влиянием красного криптонита Кларк отправляется в Метрополис, в то время как его друзья и родители отчаянно пытаются найти его. Лекс вынужден столкнуться лицом к лицу со своими страхами на необитаемом острове, в то время как Лайнел присутсвует на его похоронах. Джонатон Кент должен заплатить огромную цену за возможность, чтобы вернуть сына.

3х02
В то время, как Кларк и Джонатон сражаются между друг другом, Лекс возвращается в Смолвиль и сталкивается со своим отцом и своей женой. Кларк должен иметь дело с главой криминального мира Морганом Эджем, который сопровождает его в Смолвиль. Кларк пытается восстановить свои отношения с Ланой и Хлоей. Лекс должен определить, кто пытался убить его - Лайнел или Хелен.

3х05
Перри Уайт -многообещающий журналист, чья карьера была уничтожена Лайнелом Лютером, приезжает в Смолвиль в поисках историй о инопланетянах для бульварной газеты. Несмотря опьянение, Перри верит, в то что видел, как Кларк использовал его супер-скорость, поэтому он разрабатывает опасный план раскрытия силы Кларка.Тем временем, Лекс узнает, что у Перри есть информация о темном прошлом его отца, Лайнела

3х06
Кларк узнает, что Джор-Эл был уже на земле 40 лет назад. Дядя Ланы, которому был вынесен приговор за убийство его жены 40 лет тому назад, показывает ей фотографию мужчины, он верит, что этот человек убил ее тетю, Лана потрясена увидев на фотографии скитальца похожего на Кларка. Уверненный, что этот мужчина - Джор-Эл, раследование Кларка приводит его к медальону с криптонитом, что позволяет ему видеть отрывки прошлого, и он узчнает,что Джор-Эл начал здесь жить за долго до появления Кларка на земле.

3х07
Кларк становится подозрительным, когда Лана неожиданно становится ближе с школьным приятелем и начинает вести себя, как бунтарка, что в конечном счете оборочивается для нее тюремной камерой. Подозрения Кларка подтверждаются, когда он обнаруживает, что у нового друга Ланы есть магнетические способности, которые позволяют ему передвигать предметы и изменять чувства людей. Когда Кларк пытается осободить Лану от этой зависимости, которая контролирует ее, она пытается убить Кларка. Тем временем, Лекс обнаруживает, что Хлоя все больше углубляется в расследование прошлого его отца, он предлагает объединить их усилия против Лайнела.

3.11
Кларк и Лана, каждый из них делает попытку уничтожить жизнь Хлои, по неизвестным причинам после того, как они получают письмо из Института Саммерхолт. Кларк должен найти отправителя этого письма, после того как Хлоя разоблачит их, она обнаружила доказательство того, что они проводят исследования контроля над разумом человека. Хлоя осознает, что они должны попытаться убить ее для того, чтобы сохранить это в тайне. Лана решает арендовать квартиру над кафе Адама, не смотря на то, что она чувствует, что он скрывает нечто опасное о своем прошлом.

3.12
Кларк обнаруживает, что его одноклассник Джордн может предвидеть будущее, но он ужасается когда Джордан говорит ему, что видит Лану погибающую на пожаре в ближайшие несколько дней. Хлоя расследует поднаготную Адама, из-за егоподозрительного поведения. И она обнаруживает несколько волнующих подробностей.

3.13
Пит умышленно проигрывает уличную гонку и организаторы угрожают его жизни, поэтому он просит Кларка использовать свою силу, чтобы остановить их. Кларк взбешен из-за того, что тот поставил его в такое положение, он должен помочь ему и сохранить секрет. Тем временем, Джонатон начинает сожалеть о последствиях его сделки с Джор-Элом.

3.17
Когда Джонатан начинает вести себе странно, Кларк верит, что Джо Эл отправляет сообщения Джонатону, через ключ, и это становиться причиной того, что отец уходит из семьи. Кларк спускается в пещеры, чтобы столкунться лицом к лицу со своим биологическим отцом, но Лайнел ловит его там и начинает собирать кусочи мозаики воедино, поручая это дело надежному доктору Суонну. Два милиардера стлкиваются между собой, и здесь открываются истинные мотивы Лайнела.

3.18
Когда Хлоя случайно вдыхает пары необычного крипто-газа,то она открывает, что это действует, как сываратка правда для тех, кто с ней разговаривает. Хлоя решает использовать свою новою способность и открыть секрет Кларка. Но ее новая сила может привести к фатальном результатам и Кларк должен найти противоядие прежде чем он раскроет о нем правду или хуже того, умрет.

3.19
Веря, что ключ сообщивший о прошлом отца Лекса был потерян, когда его память была стерта, Лекс решает присоединииться к эксперементальной  программе доктора Гарненра, вспомнив все  он сможет выдать отца ФБР. Зная, что Лекс раскроет его секрет, если вернет память, Кларк  решает остановить его, но его ловит Лайнел и доктор, и подвергают такому же радикальному лечению, что Лайнел может выяснить секрет Кларка.

4.01
ЛОИС ЛЕЙН ПОЯВЛЯЕТСЯ В СМОЛВИЛЕ, КЛАРК ЛЕТАЕТ И ПРИГЛАШЕННАЯ ЗВЕЗДА МАРГОТ КИДДЕР - Кларк возвращается в Смолвиль перепрогамированный в Кел-Эла. Полный решимости исполнить свое предназначение Кел-Эл обращается к небу, чтобы украсть мощный криптонический кристалл. Тем временем Лоис Лейн приезжает в город, чтобы расследовать убийство своей кузины Хлои. Также Лана возвращается из Парижа с новыми планами и новым бойфрендом, Джонатан находиться в коме, Лайнел сталкивается с новой страшной жизнью в тюрьме.

4.02
Кларк и Лоис расследуют мнимое убийство убийство  Хлои, но их останавливает армейский офицер, Генерал Сэм Лейн, который является отцом Лоис. Лоис подозревает, что Сэм знает больше о смерти Хлои. Кларк узнает, что Сэм недавно общался с Лексом. Джейсон приезжает из Парижа и уверяет Лану в необходимости продолжения их отношений. Подозревая, что Хлоя все еще жива, Лайнел отправляет наемного убийцу с способностью преобразовывать свои кончености в металическое оружие, чтобы Хлоя не смогла дать показания против него.

4.03
Кларк встречает неожиданно нового противника в лице стеснительной ученицы, которая обращается к пластическому хирургу, чтобы улучшить свою внешность и поднять свою популярность. Однако все меняется, что ее криптонит увеличивает красто, но это наносит ущеррб тем кого она целует  и она решает, что ее следущей жертвой будет Лана. Тем временем Джейсон и Лана продолжают прятать их взаимоотношения от Кларка.

4.07
Хлоя вовлечена в подпольный азартный клуб в школе, студентом по обмену Михаилом Мкзптлк и теряет все свои сбережения во время футбольного матча, после тогок как Михаил использовал свои силы для контроля всех игроков, включая Кларка. Когда Хлоя узнает секрет Михаила, он похищает ее и угрожает убить ее, если Кларк не проиграет игру. Лекс угрожает Михаилу депортацией, если тот не использует свои силы в пользу Лекса.

4.08
После того как Лана произносит заклиние написанное в 1600 годах, она, Лоис и Хлоя  становятся одержимы ведьмами, которые были  соженны заживо. Три ведьмы  вернулись, чтобы добиться отмщения и найти мощные криптонические кристаллы, нанеся вред и ущерб в городе. Кларк  пытается остановить ведьм, но они  лишают его силы и заставляют раскрыть место положение кристала, который он спрятал в пещере.

4.09
После того как Лекс обвинен в убийстве, Кларк намеревается доказать его невиновность. Клянясь, что он изменился, Лайнел предлагает Кларку  проникнуть в суть преступления, но он требует кое-что взамен. Тем временем Лана встречает родителей Джейсона и видит яркое воспоминание происшествия в Париже, подтверждающий свое подозрение, что мать Джейсона была там, когда Лана делала татуировку.

4.13
Чтобы заполучить Кларка в  футбольную команду, Мет Ю отправляет их звездного игрока Джефа для того чтобы тот показал Кларку, как Мет Ю заинтересован в нем. Один из игроков Мет Ю умирает при загадочных обстоятельствах, и Лоис арестована по обвинению в этом убийстве. Кларк раскрывает, что Джеф обладает суперсилой и использует  ее  для парализации тех, кто встанет на его пути - включая Лоис. Тем временем Хлоя продолжает наблюдать за Кларком и узнает все больше его секретов.

4.14
Ведя машину,  Лоис случайно сбивает собаку, она приносит ее на ферму, чтобы вылечить. Кларк узнает, что это собака необычная после того как  щенок поднимает машину для того чтобы найти мячик. Кларк и Лоис узнают, что собака это результат неудачного эксперемента ЛютерКорп, и использовалась для совершения преступлений, и когда Лоис похищена грабителями, а Кларк беспомощен из-за действия криптонита, собака спасает им жизнь. Тем временем Лана озадачена участием Джейсона в делах его мамы.

4.15
Узнав, что Джейсон и Лекс находятся в Китае в поисках таинственного криптонического кристалла, Кларк и Лана следует за ними в надежде найти его первыми. Кларк находит артефакт, кторый приведет их к кристаллу, но он должен сразиться с ведьмой Исобел, которая собирается снова завладеть телом Ланы, чтобы забрать кристалл себе. А Лекс знает больше информации о кристаллах, чем кажется.

4.19
Кевин, мальчик который может влиять на людей так, что они временно теряют  память, и он использует свои силы на Кларке, у которого теперь полная потеря памяти. Хлоя рассказывает Кларку о произошедшем, и она должна научить его использовать свои силы в тайне от других. Путешествуя по страницам памяти Кларк встречает Лану, и влюбленный в нее вновь, он решает поделится с ней секретом. Пользуясь ситуацией, Лекс убеждает Кларка показать ему, где спрятаны три камня

4.20
Кларк и Лана находят брошенного ребенка на кукурузном поле и приносят его на ферму Кентов. За несколько  дней новорожденный вырастает в 7 летнего ребенка. Кларк и Лана понимают, что он быстро стареет, и они начинают искать выход, прежде чем болезнь убьет его. Тем временем Женивьев просит Лайнела убить Лану иначе он окажется в тюрьме снова.

4.21
Кларк должен остановить школьного фотографа после того, как раскрывает его секрет создании копии школы и начинает похищать школьников, начиная с Хлои, чтобы увековечить память о славных днях школы навсегда. Лекс и Лайнел похищены, их пытает Тигус, в надежде найти кристалл. После того как Женивьев осознает, что кристалл у Ланы, она решает покончить с охотой на кристалл раз и навсегда.

4.22
Кларк начинает понимать зачем он был послан на землю после ночного кошмара о том, что нечто ужасное должно произойти в Смолвиле. Кларк приходит в пещеру, чтобы найти ответы у Джо-Эла. Его биологический отец говорит, что он должен соединить три кристалла немедленно иначе произойдет катастрофа на планете и даже Кларк не сможет остановить это. Тем временем Лекс помогает Лане исчезнуть из Смолвиля после смерти Женивьев Тиг, а затем совершает шокирующий поступок отбирая один из кристаллов у Лайнела. Понимая, что кристаллы связаны с Кларком, Хлоя пытается остановить Лекса от раскрытия правды.

5.04
Отдых на кратерном озере заканчивается драматично, когда Лоис (Эрика Дюранс) ударяется головой во время прыжка в озеро. Но Кларк (Том Уэллинг) не успевает спасти ее, это делает за него загадочный пловец Эй Си ака Аквамен (Алан Ричсон). Профессор Файн рассказывает Кларку, что Лекс (Майкл Розенбаум) скрытно разрабатывает оружие. Эй Си пытается проникнуть в лабораторию Лекса, чтобы уничтожить оружие, но оказывается в руках Лекса. Приглашённые актёры: Эрика Дюранс (Лоис), Джеймс Марстерс (Профессор Файн)

5.05
Лана (Кристин Кройк) буквально в последнюю  решает поступить в Университет Метрополиса. Поскольку она опоздала с поступлением и общежития заняты, она пробует стать членом общины Университета, чтобы получить место в их доме. Однако ее новые подруги предлагают ей больше чем место в доме. Они обращают ее в вампира и приказывают убить Кларка (Том Уэллинг). Тем временем Хлоя (Эллисон Мэк) отправляется на собеседование в Дэйли Плэнет, желая проходить там практику. Но суровому главному редактору (приглашенная звезда Кэрри Фишер – принцесса Лея из «Звздных Войн» - прим. пер.)  не легко угодить.

5.06
Кларк и Джонатан в волнении. Сенатор Джейк Дженнингс, старый друг Джонатана, прибывает к Кентам, ища поддержки в предвыборной кампании. Но тут погибает девушка из стрипклуба, выясняется, что она была любовницей Дженнингса. Это делает его первым подозреваемым. В поисках ответа, кто же убил девушку, Хлоя убеждает Лоис устроится в клуб в качестве стриптизерши.